1、区内高新技术企业从被认定之日起，减按15%的税率征收企业所得税；出口产品产值达到当年总产值70%以上的，减按10%的税率征收企业所得税；新办的非外商及非台、港、澳、侨投资的高新技术企业，从投产年度起，两年内免征企业所得税。
2、区内生产性外商及台、港、澳、侨投资的高新技术企业，经营期在十年以上的，从获利年度起，第一年和第二年免征企业所得税，第三年至第五年减半征收企业所得税，减半期满后，如经考核仍为高新技术企业，可再延长三年减半期。以后按15%的税率征收。
3、对增值税一般纳税人销售其自行开发生产的软件产品，2010年前按17％的法定税率征收增值税，对实际税负超过3％的部分即征即退。
4、进入高新区留学人员、博士创业园租用房产的被孵化企业，按市场平均价，在100平方米面积内第一年免收租金，第二年60%，第三年80%；超过100平方米的部分第一年的前半年免收租金，之后两年半内按80%的标准收取。
５、凡进入麓谷的高新技术企业基本建设的各项工程报建费（包括相配套的生活、公共建筑实施）总和按42元/平方米的优惠价收取。
６、对园内高新技术企业实行挂牌无费管理。无费管理企业只纳税，不缴行政事业性费用。
７、区内企业根据情况可采取提前报关、联网报关、快速报关、上门验收、加急通关、担保验收等便捷通关措施。
